高通量纳米孔测序系统（PromethION 2 Solo）

基本信息

设备品牌：Oxford Nanopore

设备型号：PromethION 2 Solo

放置地点：医学园2栋1510

管理员：刘姗姗

联系邮箱：liushansh@mail.sysu.edu.cn

主要规格及技术指标

1. 测序类型：单分子测序，无需荧光标记
2. 直接DNA测序，无需PCR扩增，另有 PCR扩增产物也可以进行测序
3. 直接RNA测序，无需反转录成cDNA，无需PCR扩增，碱基修饰可直接检测、 直接进行表观遗传学分析；另有反转录成cDNA以及进行PCR扩增可选。
4. 运行时间：可设置0-72h
5. 单次可运行芯片数量：1-2，可同时或独立运行；
6. 单次运行最高数据量超过400G/Run
7. 起始样品总量 10pg-1ug
8. 测序纳米孔数量：≥12000个/芯片
9. 实时测序：测序的同时可立即获取测序数据并进行数据分析，无需等待完成测序后才获取数据并分析
10. 库制备时间：有快速文库制备的方案，可在10分钟内完成文库制备
11. 测序读长：对序列读长无理论限制，目前最高读长可达到单条序列4.6Mb
12. 原始数据碱基识别准确率不低于99%，30X测序深度时≥99.9%
13. 数据存储：直接存储原始数据及导出为fastq文件格式
14. 碱基修饰识别：不仅得到核酸序列，同时可直接识别碱基修饰（如甲基化）
15. 数据分析：可实现在线实时分析或本地分析，免费提供≥30种可用于分析测序数据的常用工具用于数据分析，包括数据质量控制、barcode 拆分、序 列比对、基因组组装、宏基因组分析、扩增子分析、测序错误校正、变异分析、碱基修饰识别等。