MA Jiaxin

Associate Professor / Master's supervisor

Direction:Evolution and Genomics

Research Area:生物多样性，生物地理，保护生物学，系统进化学，淡水和海洋生物学，基因组学

Email: majx26@mail.sysu.edu.cn

Links: https://abel-sysu.github.io/en/

个人简介

马嘉欣 Ka Yan MA

性别：女

职称：“百人计划” 副教授

导师类型：硕士生导师

学历：博士

电子邮箱：majx26@mail.sysu.edu.cn

网站：https://abel-sysu.github.io/en/

研究兴趣

我们是一个年轻而又富有朝气的实验团队，对水生生物学、生物多样性及其进化有着广泛的兴趣。我们的实验室扎根于中国南部地区，重点关注印度-西太平洋地区的动物群，这些动物群具有高度的生态多样性和系统发育多样性，同时也不断地受到全球气候变化和当地发展的威胁。我们力求揭示这片海洋和淡水生物多样性热点地区的生物学及其进化和环境适应（如温度、盐度、污染等）。

正在进行的项目包括：

  • 甲壳纲的系统基因组学和系统发育生理学
  • 淡水十足目动物的生物地理学和进化
  • 珊瑚礁鱼的进化生物学与保护遗传学

详细信息请见：https://abel-sysu.github.io/en/join/
 

教育经历

  • 2015  James Cook University，澳大利亚 海洋生物学博士
  • 2009  香港中文大学 生物学硕士
  • 2006  香港中文大学 生物学学士

工作经历

  • 2020.10-至今    中山大学生态学院副教授
  • 2018-2020.10   香港中文大学生命科学学院博士后研究员
  • 2015-2018     香港中文大学生命科学学院副研究员
  • 2009-2010     香港大学生物科学学院研究助理

学术成就

主要学术奖励：

  • 2012 教育部高等教育优秀科研成果二等奖（第三完成人）
  • 2010 - 2014 詹姆斯库克大学国际研究学者
  • 2008 澳大利亚-长江研究学者奋进奖

主要学术兼职：

  • 国际自然保护联盟物种生存委员会，中国物种专家组、石斑与隆头鱼专家组
  • 担任《Ecology and Evolution》、《Frontiers Marine Science》、《Journal of Crustacean Biology》、《Molecular Phylogenetics and Evolution》、《PLOS One》、《Royal Society Open Science》、《Zoological Journal of the Linnean Society》、《Zoological Scripta》、《Zoological Studies》等期刊审稿人
  • 担任《Frontiers in Marine Science》 (Marine Molecular Biology and Ecology) 杂志Review Editor、《Frontiers in Genetics》 期刊 Topic Editor

科研项目

  • 国家自然科学基金，青年科学基金项目，基于系统发育基因组学的华南溪蟹生物地理历史研究，2023-01 至 2025-12，在研，主持
  • 广东省基础与应用基础研究基金，青年基金项目，系统发育基因组学探讨胸孔亚派螃蟹的适应性进化的时空演变格局，2021-10 至 2024-09，在研，主持

论文专著

论文列表（共46篇国际科学期刊论文）：

代表性论文（*通讯作者；†共同第一作者）：

  • Yu HY, Chu KH, Tsang LM, Ma KY* (2024) Incomplete lineage sorting and long-branch attraction confound phylogenomic inference of Pancrustacea. Frontiers in Ecology and Evolution. 12,1243221.
  • Wu Z, Chu KH, Ma KY* (2023) Transcriptome analysis of multiple tissues in the shrimp Penaeus vannamei reveals the typical physiological response to three pathogens. Journal of Marine Science and Engineering. 11, 389.
  • Yang CH†, Ma KY†, Chu KH, Chan TY (2023) Making sense of the taxonomy of the most commercially important shrimps Penaeus Fabricius, 1798 s.l. (Crustacea: Decapoda: Penaeidae), a way forward. Aquaculture, 563, 738955.
  • Mu X*, Yang Y, Sun J, … Ma KY* (2022) FishPIE: A universal phylogenetically informative exon markers set for ray-finned fishes. iScience, 25, 105025. 
  • Chow LH, Tsang LM, Chu KH, Ma KY* (2022) Genetic assessment of the rare freshwater shrimp Caridina logemanni endemic to Hong Kong and its hybridisation with a widespread congener. https://doi.org/10.1071/MF21192
  • Ma KY, Chow LH, Tsang LM, De Grave S, Chu KH (2021) Contrasting population structures of freshwater atyid shrimps in Hong Kong and their conservation implications. Marine and Freshwater Research. 72, 1667-1678
  • Cui Z, Liu Y, Yuan J, Zhang X, Ventura T, Ma KY… Li F, Chu KH (2021) The Chinese mitten crab genome provides insights into adaptive plasticity and developmental regulation. Nature Communications. 12, 2395.
  • Veldsman WP, Ma KY, Hui JH, Chan TF, Baeza JA, Qin J, Chu KH. (2021) Comparative genomics of the coconut crab and other decapod crustaceans: exploring the molecular basis of terrestrial adaptation. BMC Genomics. 22(1):1-5.
  • Tang Y, Ma KY, Cheung MK, Yang C-H, Wang Y, Hu X, Kwan HS, Chu KH (2021) Gut microbiota in decapod shrimps: evidence of phylosymbiosis. Microbial Ecology. https://doi.org/10.1007/s00248-021-01720-z
  • Leung TY, Ma KY*, Liu M, Planes S, de Mitcheson SY (2020) Population genetic structure of a marine pelagic egg producer and popular marine aquarium species, the mandarinfish Synchiropus splendidus. Zoological Studies. 59, 68.
  • Zhang X, Yuan J, Sun Y … Ma KY… Chu KH, Liu B, Li F, Xiang J (2019) Penaeid shrimp genome provides insights into benthic adaptation and frequent molting. Nature Communications. 10, 356.
  • Ma KY, Qin J, Lin C-W, Chan T-Y, Ng PKL, Chu KH, Tsang LM (2019) Phylogenomic analyses of brachyuran crabs reveal a paraphyletic Heterotremata and support early divergence of primary freshwater crabs. Molecular Phylogenetics and Evolution, 135, 62-66.
  • Ma KY, Colin PL, Sadovy de Mitcheson Y, Dawson MN (2019) Phylogeography and Conservation Biogeography of the Humphead Wrasse, Cheilinus undulatus. Frontiers of Biogeography, 11, http://dx.doi.org/10.21425/F5FBG42697.
  • Ma KY, van Herwerden L, Newman SJ, Berumen ML, Choat JH, Chu KH, Sadovy de Mitcheson Y (2018) Contrasting population genetic structure in three aggregating groupers (Percoidei: Epinephelidae) in the Indo-West Pacific: the importance of reproductive mode. BMC Evolutionary Biology, 18, 180.
  • Ma KY†, Chow LH†, Wong KJH, Chen H-N, Ip, BHY, Schubart CD, Tsang LM, Chan BKK, Chu KH (2018) Speciation pattern of the horned ghost crab Ocypode ceratophthalmus (Pallas, 1772): an evaluation of the drivers of Indo-Pacific marine biodiversity using a widely distributed species. Journal of Biogeography, 45, 2658-2668.
  • Ma KY and Craig MT (2018) An inconvenient monophyly: an update on the taxonomy of the groupers (Epinephelidae). Copeia, 106, 443-456.
  • Chow LH, Ma KY*, Hui JH, Chu KH (2018) Isolation and characterization of polymorphic microsatellite loci for Caridina cantonensis and transferability across eight confamilial species (Atyidae, Decapoda). Zoological Studies, 57, 19.
  • Qin J, Hu Y, Ma KY, Jiang X, Ho CH, Tsang LM, Yi L, Leung RWT, Chu KH (2017) CrusTF: a comprehensive resource of transcriptomes for evolutionary and functional studies of crustacean transcription factors. BMC Genomics, 18, 908.
  • Wong WY, Ma KY*, Tsang LM, Chu KH (2017) Genetic legacy of tertiary climatic change: a case study of two freshwater loaches, Schistura fasciolata and Pseudogastromyzon myersi, in Hong Kong. Heredity, 119, 360-370.
  • Ma KY*, Craig MT, Choat JH, van Herwerden L (2016) The historical biogeography of groupers: clade diversification patterns and processes. Molecular Phylogenetics and Evolution, 100, 21-30.